公元191年，公孙瓒以讨伐董卓为名发兵进入冀州，实际打算袭击韩馥，韩馥惴惴不安。
恰逢袁绍还军延津，派遣高干、荀谌等说服韩馥归顺袁绍，沮授和长史耿武、别驾闵纯则劝谏韩馥守住冀州。
他们认为：“冀州虽然小，能上阵的人有百万，粮食能支撑十年，袁绍是一个外来人且军队困顿，仰我鼻息，好比婴儿在大人的手掌中，断绝哺乳就能立刻饿死他。为什么要把冀州送给袁绍？”韩馥不听，把冀州让给了袁绍。
袁绍占领冀州后，任命沮授为别驾从事史，又向沮授发问：“现在贼臣四处作乱，朝廷四处迁移。我们家族世代受恩宠，应当意志坚定，竭尽全力光复汉室。然而齐桓公没有管仲不可能成就霸业，勾践没有范蠡也不能保国。我现在想和您齐心协力，共同安定国家社稷，您有什么计谋来帮助我呢？”
沮授回答道：“将军您弱冠之年即受重用，扬名天下。正值董卓废立皇帝之际，您又奋力发扬自己的忠义之心，一人一马挺身而出，使得董卓畏惧，渡过黄河向北而去，渤海郡的百姓皆臣服于您。您拥有一个郡的军队，加之冀州的人马，势力可以延伸至黄河以北，名声大振。如果向东讨伐，则可以灭黄巾军，攻打黑山，可以灭掉张燕，向北攻伐，必定俘虏公孙瓒，以威势胁迫西戎地区，可以平定匈奴势力，横扫黄河以北，合并四个州的地盘，招揽英雄人材，坐拥百万之众，在长安迎接皇帝，恢复在洛阳的宗庙，号令天下，征讨不服从的人。用这种条件决胜负，谁能抵御！再过几年，建功立业并不困难。”
袁绍听后大喜，表示赞成，立刻任命沮授为监军、奋威将军。
公元195年，沮授劝说袁绍迎回汉献帝，迁都邺城，挟持皇帝并以皇帝名义统治天下，招贤纳士来讨伐不听从中央命令的人。
袁绍听后很高兴，准备听从沮授建议。郭图、淳于琼则反对道：“汉室衰败多年，现在想兴旺，难道不难吗！现在您占有州郡，兵众多人，秦王朝失势，天下群雄皆起，先到先得。如果迎来天子，听从他权力会削弱，不听从则是违背命令，这不是好的计谋。”
沮授反驳道：“现在迎回天子，是大义，是符合时局大计谋，如果不早点行动，必定有人先行迎接。权变而不失时机，成功在于行动迅速。将军要行动啊！”袁绍没有听从沮授的建议。
沮授劝袁绍迎接汉献帝，挟天子以令诸侯
袁绍派遣大儿子袁谭治理青州，又派遣二儿子袁熙治理幽州，外甥高斡治理并州。
沮授劝谏说：“一只兔子逃跑，有一万个人追，其中一人捕获兔子，其他人都会停下，因为归属已经确定，选择用人时，年龄相仿要挑选其中的贤能之士，能力相仿则要占卜确定，这是古人的规矩。希望您以先人成败为戒，深思追逐兔子以定名分的内涵。”
袁绍不听，反驳道：“我就是想让四个孩子各占据一州，来考察他们的能力。”沮授从帐中出来后说：“灾祸就要从这里开始了。”
袁绍要出兵讨伐曹操，沮授、田丰劝谏道：“军队出征多年，百姓疲惫，粮仓少有积蓄，赋税繁重，这是国家的重要隐患。应该先派遣使者告知天子，发展农耕，与民休息。如果不能解决，就上表说曹操阻断大王军队的去路，然后我们驻扎黎阳，在河内建造船只，修造兵器，把精兵分队派遣到周边驻扎。那么三年之内，我们的大事就成功了。”
审配、郭图则认为，袁绍手握重兵，数量几倍于曹军，应该抓住良机，讨伐曹操。
沮授则认为：“救乱诛暴的军队被称为义军，靠数量称强的军队称为骄兵，义军所向披靡，骄兵则必然溃败。曹操把天子安置在许都，现在举军攻打，有违背道义。而且朝廷制定的克敌制胜的谋略不在于强弱。曹操法令严明，不是公孙瓒之辈。现在放弃万安之策，兴无名之师，我为您感到忧虑。”
郭图等反驳认为，袁绍攻打曹操，不存在师出无名。而且文臣武将都竭力尽忠，如果不早定大业，是思虑的过失啊。
还向袁绍列举了吴国、越国的兴衰存亡的例子，认为沮授的计谋很持重，但不够随机应变。袁绍听罢，听从了审配、郭图的意见。
官渡之战前夕，沮授会见其宗族之人，大散其财并说：“如果战胜的话，我们威无不加，如果战败，我们自身不保，真是悲哀啊！”
弟弟沮宗说：“曹操的军马不如我们，你为什么要惧怕呢？”
沮授回答道：“以曹操的智谋，又有天子这一资本，我军虽然攻克公孙瓒，但军士疲劳，将军骄横，军队的破败就在这一战了。现在就和扬雄所言的‘六国蚩蚩，为嬴弱姬’的情况一样。”
公元200年，袁绍进军黎阳，派遣颜良在白马津攻打刘延。沮授向袁绍进谏道：“颜良性格狭隘急促，虽然骁勇善战，但不可以独自指挥。”
袁绍不听。曹操援救刘延，和颜良激战，后来打