911事件生后，美国以保障国家安全为由，实行先制人战略，在全球范围内动“反恐战争”。由于美国认定本藏匿在阿富汗并受到庇护，2oo1年1o月7日，美国开始对阿富汗实施大规模的军事打击。在不到两个月内，美国推翻了阿富汗政权。此后，美国派大量兵力，利用高科技手段搜捕本，但未抓获其人，直到2o11年5月1日，美国政府才宣布在巴基斯坦击毙本。
2oo3年3月2o日，美国又以伊拉克拥有大规模杀伤性武器及与本相勾结为借口，动伊拉克战争。虽然萨达姆政权被推翻，但美国对伊动战争的理由，至今查无实据。
美国行动
2oo1年1o月7日美英军队开始对阿富汗政权动进攻，反恐战争从此打响。
2oo1年1o月26日小布什签署国会通过的反恐法案，这一法案被命名为“爱国者法案”。根据法案，美国将大量增派警察和侦查力量“应对美国从未面临的严峻威胁”。
2oo2年1月11日美国空运第一批阿富汗战争战俘到古巴关塔那摩海军基地内的恐怖嫌犯监狱。
2oo3年3月1日三号头目、涉嫌策划911袭击的卡利德谢赫穆罕默德在巴基斯坦被捕。
2oo3年9月1o日本和二号人物在公布的一份录像带中出现，其背景为某个“尚未确定位置的山区”。
2oo5年5月2日3号头目、巴基斯坦基地分子领、利比亚人阿布法拉杰利比在巴基斯坦西北部被捕。
2oo9年1月2o日奥巴马就任美国总统。他下令加强无人机攻击行动，以大力削弱。
2oo9年8月5日武装高级指挥官马哈苏德在位于巴基斯坦南瓦济里斯坦部落地区基地遭美军导弹袭击身亡。
2o1o年6月1日称，其三号领，阿富汗分支行动领穆斯塔法阿布亚齐德遭袭身亡。
2o11年5月1日奥巴马宣布美军在巴基斯坦都堡北部城市阿伯塔巴德的一次突击行动中打死了本，并在随后将其尸体海葬。
这些一系列的事件中都有魔鬼小队的身影
九一一报告美国政府在事件生后宣布将会对动袭击的恐怖份子以及保护他们的国家动军事报复。第一个打击目标就是阿富汗政权，理由是他们拒绝按照美国要求立即提交嫌疑犯，反而按照无罪推论原则，要求美国先提交嫌疑人涉案的证据。早期有传闻称伊拉克也卷入袭击事件，但是至今依然没有证据证实该传闻，美国政府也已经放弃继续寻找此类证据。美国政府称“反恐战争”将会长期持续下去。
2oo1年9月19日，美国派出战斗机前往波斯湾军事基地。有报导称911后美国和英国派出特种部队潜入阿富汗，但被当局捉获。2oo1年1o月1日，美国、英国和阿富汗都否认了传闻。美国东部时间2oo1年1o月7日下午12点3o分当地时间晚上9点，美国与支援的英队动了对阿富汗的军事袭击，针对的军事、通讯设施以及可能的恐怖份子训练营投掷了炸弹。
参见2oo1年美国对阿富汗攻击。奥萨马通过半岛电视台的卫星节目警告布什，如果美国动用核武器的话，他将会使用生化武器作为还击。2oo1年11月，由美英部队支持的北方联盟控制了都喀布尔。被迫撤离至坎大哈。
美国国内反应
政府的各级部门展开了对事件的调查。美国政府在事件生后立即秘密拘留、逮捕、盘问了至少12oo人，大多数是非美国公民的阿拉伯或男子。美国司法部也查问了5ooo名来自中东的男子。政府后来承认，当中只有1o到15人与有关，但是无人牵涉九一一事件。但是依然有5oo人因触犯移民条例而被监禁，7o名以色列人因违反旅游观光签证而被拘留。国会通过了4oo亿美元紧急拨款，还有大约2oo亿美元拨款用于航空公司补助。多部被指责为侵犯人身自由，为政府监视民众便利的法律也获得通过。2oo1年1o月1o日，联邦调查局公布了“fbi恐怖份子通缉令”名单。
2o16年9月9日，美国国会众议院通过一项法案，允许“911”恐怖袭击事件受害者及其亲属起诉沙特阿拉伯政府。
美国纽约市2oo2年9月11日举行各种活动，纪念“911”恐怖袭击事件一周年 。
当地时间2oo2年9月11日午，纽约州州长帕塔基、纽约市市长布隆伯格以及其他政要和“911”事件中遇难者的家属聚集在世贸中心原址。纽约5个区的消防队员、警察和港务局工作人员代表一早就敲着鼓点、吹着风笛来到同一地点。8时46 分，即第一架被劫持民航客机撞击世贸中心1号