林深看着舷窗外飞逝的星流，起源之树的幼苗突然展开新叶，叶片上浮现出绿色行星的影像：行星表面有连绵的森林，森林中心有棵参天大树，树干上的纹路，同时包含了沙漠遗迹、云海星图和地球起源之树的特征。“这颗星球是共生文明的枢纽，”他肯定地说，“那里一定藏着连接所有共生网络的钥匙。”
跃迁结束时，飞船正好抵达绿色行星的轨道。这颗星球的大气层呈现出淡绿色，云层中漂浮着发光的种子，种子落地的瞬间就会长出幼苗。伊洛调整飞船高度：“检测到地面有建筑群，不是自然形成的！”
透过云层，他们看到森林边缘有片石质建筑，建筑的轮廓与地球的古城墙相似，城墙顶端长满了发光的苔藓，苔藓组成的图案，正是云织者传递的符号。而在建筑群的中心，有座金字塔状的塔楼，塔楼顶端的水晶，正散发着与悖论种子同源的光芒。
“是共生文明的古城！”苏璃激动地说。飞船降落在塔楼前的广场上，广场的地面刻着巨大的星图，星图的中心位置，嵌着块凹槽，凹槽的形状，与他们从冰原带回来的冰晶完全吻合。林深取出冰晶，将它嵌入凹槽——冰晶接触凹槽的瞬间，整个广场的星图亮起，光芒顺着地面的刻痕流动，激活了塔楼的水晶。
水晶射出一道光柱，直冲云霄，将云层中的发光种子全部吸引过来，种子在光柱中凝聚成光带，光带顺着塔楼的墙壁流淌，注入地下。广场边缘的石门缓缓打开，门内的通道两侧，摆放着刻有共生纹路的石碑，石碑上的图案，正在随光带的流动逐渐清晰。
“这些石碑是记忆载体，”艾拉抚摸着石碑，“它们在记录共生文明的历史。”众人走进通道，石碑上的图案开始动态播放：画面中，穿着长袍的原住民正在培育共生种子，他们将种子送往不同的行星，建立共生网络；后来，灰色矮星突然出现，污染体随之扩散，原住民们为了保护枢纽星球，将核心能量封存在塔楼，用星图和冰晶作为钥匙。
通道尽头是间圆形大厅，大厅中央的石台上，放着个金属圆盘，圆盘上刻着七颗行星的图案，其中三颗已经亮起——正是他们到访过的星球。圆盘旁的石壁上，有行用光尘组成的文字，艾拉的翻译仪显示：“共生之网，始于同源；七星归位，污染自散。”
“原来需要激活所有行星的核心，才能启动净化程序。”林深看着圆盘，“我们已经完成了三分之一。”就在这时，大厅的地面突然震动，石壁上的文字开始闪烁，圆盘上亮起的三颗行星图案突然变暗。艾拉的探测仪发出警报：“检测到大量污染体正在靠近，它们的能量特征与灰色矮星完全一致！”
塔楼顶端的水晶光芒骤减，广场上的星图开始褪色。林深冲到石台前，将悖论种子晶体放在圆盘中央——晶体与圆盘接触的瞬间，六色光流顺着圆盘的纹路蔓延，原本变暗的三颗行星图案重新亮起，甚至比之前更耀眼。
大厅外传来剧烈的撞击声，污染体已经突破了城墙的防御。伊洛握紧能量枪：“我去守住入口，你们尽快找到启动防御的方法！”林深点头，目光扫过大厅的石壁，发现角落有个与起源之树根系形状相同的凹槽。他让苏璃取出培育舱里的飞虫，飞虫们集体飞进凹槽，翅膀的光流与凹槽的纹路融合，石壁缓缓移开，露出个隐藏的控制台。
控制台上有七个按钮，按钮的形状对应着七颗行星。林深按下已经激活的三颗行星按钮，大厅的穹顶突然打开，露出天空中的光带，光带凝聚成防护罩，将整个古城笼罩在内。污染体撞击在防护罩上，发出沉闷的响声，却无法穿透。
“暂时安全了。”苏璃松了口气，但很快又皱起眉头，“可防护罩的能量在消耗，我们必须尽快找到第四颗行星。”林深看着圆盘上剩下的四颗暗星，其中一颗的位置正在闪烁，闪烁的频率与沙漠星球遗迹里的机械装置能量波动相同。
“第四颗行星和沙漠星球有关联，”他指着闪烁的暗星，“它的坐标应该藏在沙漠遗迹的信息里。”艾拉立刻调出沙漠星球的探测数据，经过比对，很快锁定了坐标。当坐标输入导航，悖论种子晶体里的行星图案又亮起一颗，灰色矮星的影像则变得模糊了一些。
防护罩外的污染体突然开始撤退，它们化作黑色的流萤，消失在森林深处。伊洛回到大厅：“它们在害怕激活的共生能量，但肯定会回来。”林深看着圆盘上的四颗暗星，心中清楚，接下来的旅程只会更危险——污染体已经察觉到他们的目的，不会再给他们从容探索的机会。
塔楼顶端的水晶突然投射出影像：第四颗行星表面覆盖着金属地貌，城市的废墟中，有红色的植物在生长，植物的根须缠绕着机械残骸，将其转化为养分。影像的最后，一只机械手臂从废墟中伸出，手臂的关节处，有个与悖论种子晶体相同的接口。
“是机械与生物共生的星球。”林深眼神坚定，“那里一定有我们需要的答案。”飞船离开古城时，他们看到原住民的石碑上，新的图案正在形成——图案中