"这不可能！中和程序明明..."希卡利的声音被电流声打断。实验室突然涌入无数暗紫色光蝶，它们组成的全息影像中，海盗首领的面孔正在重组："你们以为销毁徽章就能阻止吗？暗之进化的种子早已种在你们最强大的战士体内..."
行星m-9的地表突然隆起，覆盖着生物装甲的巨大身影破土而出。它的能量反应与萧刻残留的暗能产生共鸣，所过之处的奥特曼石像全部活化，手持武器向光之国方向行进。赛罗在侦查中发现，这些石像的核心竟封印着早已牺牲的战友灵魂。
"必须唤醒萧刻！"奥特之父的声音带着罕见的焦虑，"他是唯一能同时驾驭光明与黑暗的存在。"当赛罗将意识潜入萧刻的精神世界时，看到的却是被反转力量侵蚀的记忆宫殿——所有胜利画面都在扭曲，勋章化作带刺的锁链缠绕着昏迷的战士。
在现实世界，暗能觉醒者已经突破光之国防线。它释放的暗蚀波让所有奥特曼陷入苦战，就连赛罗的超限形态也被压制。关键时刻，萧刻的彩色计时器爆发出双色光芒，他的意识在光明与黑暗的交界处苏醒，看到了被封印在反转宇宙深处的真相：所谓的暗之进化，竟是光之国初创时期为对抗宇宙级威胁而创造的终极武器。
"原来我们才是被选中的容器..."萧刻的声音在两个宇宙回荡。他的身体开始分解重组，银红战衣与暗紫纹路在碰撞中融合，最终形成全新的形态——胸口的计时器分裂为阴阳双鱼图案，背后浮现出十二道能量环。当他睁开眼时，左眼闪耀着炽热的光芒，右眼却流淌着神秘的暗紫色液体。
觉醒后的萧刻以超越常理的速度冲向战场，双手同时凝聚光明与黑暗的能量球。在赛罗和众奥的配合下，他将能量球打入暗能觉醒者的核心，引发了足以湮灭整个星域的爆炸。当光芒消散时，觉醒者已化作尘埃，而萧刻正跪在废墟中，双手颤抖着——他的奥特武装上，一半闪耀着神圣的光芒，另一半却布满了不详的暗纹。
光之国的广场上，奥特之父注视着远处的战场，眼神复杂："这场胜利...究竟是福是祸？"而在宇宙的另一端，海盗首领的笑声从破碎的全息影像中传出："好戏...才刚刚开始..."
萧刻奥特曼击败暗能觉醒者后，光之国的危机暂时得以解除，但他身上那一半光明、一半黑暗的奇特状态，却让众人忧心忡忡。希卡利奥特曼带领科研团队对萧刻展开了全面检查，试图找到稳定他体内能量的方法。可检查结果却让人大失所望，萧刻体内的光明与黑暗力量如同水火般相互对抗，随时可能再次爆发冲突，而那神秘的暗之进化力量，依旧在他体内蛰伏，仿佛在等待着下一次觉醒。
与此同时，宇宙各处因为暗能觉醒者的肆虐而陷入混乱。一些星球的生态系统遭到严重破坏，原本繁荣的文明陷入了黑暗与绝望之中。光之国决定派遣奥特战士前往各个星球进行救援和重建工作，赛罗奥特曼主动请缨，带领一支小队奔赴受灾最严重的区域。萧刻虽身体状况不佳，却也坚持同行，他深知这场灾难因自己而起，必须承担起相应的责任。
当他们抵达行星L-7时，眼前的景象惨不忍睹。城市沦为废墟，大地满目疮痍，幸存的居民们在废墟中艰难求生，眼中充满了恐惧和绝望。赛罗和萧刻立刻投入到救援行动中，他们利用自己的力量为居民们搭建临时住所，寻找食物和水源，同时还要防范因暗能残留而变异的怪兽袭击。
在救援过程中，萧刻发现自己对黑暗力量的感知变得异常敏锐。他能察觉到隐藏在废墟中的黑暗气息，这让他可以提前发现危险，保护居民的安全。但这种对黑暗力量的敏锐感知，也让他内心的黑暗面逐渐受到影响。他时常会在梦中看到那被反转力量侵蚀的记忆宫殿，那些扭曲的胜利画面和带刺的勋章锁链，仿佛在不断提醒他体内黑暗力量的存在。
一天，正当他们在救助一群被困在废墟下的居民时，一只巨大的变异怪兽突然出现。这只怪兽浑身散发着刺鼻的暗能气息，体型比普通怪兽大出数倍，它的每一次攻击都带着强大的破坏力。赛罗立刻变身为奥特曼，冲向怪兽。他施展出艾梅利姆切割，试图击退怪兽，但怪兽的皮肤坚硬无比，光线只是在它身上留下了几道浅浅的痕迹。
萧刻深知赛罗一人难以对抗如此强大的怪兽，他不顾身体的不适，也变身为奥特曼加入战斗。战斗中，萧刻发现这只怪兽的力量与之前遇到的暗能觉醒者有相似之处，似乎都受到了暗之进化力量的影响。他尝试运用新形态下的力量，双手凝聚光明与黑暗的能量，发射出一道双色光线。光线击中怪兽后，怪兽的行动出现了短暂的迟缓。