平时，五军营练习营阵，也就是主力步兵，三千营则负责巡哨，有些像宪兵的意思，真正的精锐神机营，则掌管火器，到了战时，神机营也是必须扈驾随征的部队，后来虽然京军制度又多次更改，但大体上没有什么变化！
此外，京军中还包括拱卫皇帝的侍卫亲军，如锦衣卫和金吾、羽林、虎贲、府军等12卫军，以及隶属御马监的武骧左右、腾骧左右等4卫营。
而说到地方军，则包括卫军、边兵和民兵三大类，卫军已经说过了，就是配置于内地各军事重镇和东南海防要地的地方安保军队，而且还是自给自足的那种。
边兵则是防御北方蒙古骑兵的戍守部队，配置于东起鸭绿江、西抵嘉峪关的9个军镇，也就是历史上很牛的九边雄兵，这九边雄兵可以说从明初到明末，战斗力始终不俗，即便是清朝崛起之后，对于九边雄兵，也是以劝降收编为主，而不愿意与之拼死大战。
至于民兵就复杂一些了，说白了就是军籍之外、由官府佥点、用以维持地方治安的武装，内地称民壮、义勇或弓兵、机兵、快手,西北边地称土兵,西南少数民族地区有苗兵、狼兵等土司兵。
另外还有不同行业和阶层组建的矿兵、盐兵、僧兵等，当然这些没有军籍的民兵，当遇到战争的时候，也常被朝廷召出征，等战争结束就直接令其返回原地。
可以说这就是大明朝基本的军事系统了，当初朱由校看的时候差点没昏过去，他实在想不明白，以老朱那么英明神武的人物，怎么会给大明朝设立这么一套繁琐、复杂、重复、效率低下的军事制度呢？
也正是要改变这点，所以朱由校才以现代军队体制，结合明朝军队的实际情况，设置出了一套全新的军队编制体制，当然这套新体制要像在全国推广是不可能的，所以朱由校决定先在他自己的近卫军中实行！
在朱由校这套军队体制中，首先规定了军衔制度，士兵的等级分为二等兵、上等兵、下士、中士、上士五个级别，军官则有准尉、少尉、中尉、上尉、少校、中校、上校，准将、少将、中将、上将、元帅三品十二级，其中元帅由皇帝本人担任，也就是说近卫军的军官，最高级别为上将，这样做自然是有助于皇帝对军队的掌控！
朱由校之所以直接把后世的军衔制度照搬过来，实在是因为重新设定一套军衔制度太过麻烦，而且后世的军衔制度既然得到了全世界所有国家的认可，自然有其独到和先进之处，如果为了迎合古人的习惯而进行改变，无异于自找麻烦还不讨好！
同时为了对应军衔制度，朱由校还设计了一套简易军衔标志，这套军衔为红色，不过不是佩戴的，而是直接缝制在军服或铠甲的左肩处！
由低到高分别为二等兵为一柄单刀，一等兵为两柄交叉的单刀。
下士为一杆竖直长枪，中士为两杆交叉的长枪、上士则在交叉的长枪中间，再加一杆竖直的长枪！
准尉为两柄交叉的长剑，少尉、中尉、上尉分别在交叉长剑的下方各加一道红色的细杠！
少校为一道粗一些的明黄色横杠，这也代表着近卫军为皇家所有，高级军官已经可以代表皇家了，中校、上校每升一级，加一道横杠！
准将的军衔标志为两杆交叉的明黄色火枪，象征着近卫军未来将实现火器化，少将、中将、上将每升一级，则在交叉的火枪之下，增加一条横杠！
近卫军最高军衔元帅，因为是由皇帝亲自担任，所以没有军衔标志！
同时近卫军最基本的军事单位从小旗变成了伍，对应现代军事体制也就是班，一伍编制15人，其中伍长一人、副伍长两人，之所以这么设置，是因为朱由校将伍细分为三个战斗组，这样一来伍长和两个副伍长正好各带一个战斗组！
在伍之上就是小旗，也就是现代军队中的排，每个小旗编制三伍，设小旗一名，共计46人，战时如果小旗阵亡，则由三个伍长依次顶上，伍长阵亡则由副伍长依次顶上，这样就有效地杜绝了基层军官阵亡，导致伍或者小旗失去指挥而且溃败的情况！
再往上就是总旗，也就是相当于连，每个总旗设总旗官一人，督导官一人，下辖三个小旗，同时总旗官麾下还单独设置两个伍，一个伍专门负责保护总旗官，以及向各小旗传达命令之用，另一个伍则是负责做饭的伙头军，如此一来总旗就相当于三个小旗，十一个伍，共计160人，总旗管阵亡，职务由小旗官依次顶替！
督导官是朱由校别出心裁弄出来的职务，作用相当于后世军中的指导员，负责教授士兵识字，宣讲忠君爱国的思想，最重要的则是监督军中纪律，并且对违反军纪的官兵进行处罚，不过为了不让督导官做大，朱由校还在军纪中特别加上一条，督导官与宪兵官不得参与指挥，战时要绝对服从长官军令！
而总旗之上则是镇，这相当于现代军制中的营，每镇设镇守一人，副镇守两人，宪兵官一人，下辖三个总旗，一个负责保护镇守，传达军令，整肃军纪的宪兵小旗，总